La diócesis de Babahoyo (en latín: Dioecesis Babahoiensis) es una diócesis de la Iglesia católica, cuya sede se encuentra en Babahoyo, capital de la provincia de Los Ríos, Ecuador.1
Pertenece a la Provincia Eclesiástica de Guayaquil.
El actual obispo es monseñor Skiper Bladimir Yánez Calvachi.2
Su Iglesia principal es la catedral de la Merced.
Está dividida en tres vicarías zonales: Norte, Centro y Sur.
