El vicariato apostólico de Galápagos (en latín: Vicariatus Apostolicus Galapagensis) es un vicariato apostólico de la Iglesia católica, cuya sede se encuentra en el Puerto Baquerizo Moreno, capital de la provincia de Galápagos, Ecuador.1
Esta inmediatamente sujeta a la Santa Sede.
El actual obispo vicario apostólico es monseñor Áureo Patricio Bonilla Bonilla OFM.
Su Iglesia principal es la Catedral de la Inmaculada Concepción.
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Mons. Patricio Bonilla, ofm - Obispo de Galápagos